애니메이션판 고질라의 에피소드의 방영 목록에 관한 문서이며, 아래에 표기된 방영 목록의 에피소드 제목은 원제를 번역해 표기를 한 것이다.
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1 시즌 1(1998년 ~ 1999년)
| No. | 에피소드명 | 연작 | 방송 일자(미국) |
| 1 | New Family, Part 1(새로운 가족, 1부) | 2부작 | 1998.09.12 |
| 2 | New Family, Part 2(새로운 가족, 2부) | 2부작 | 1998.09.19 |
| 3 | D.O.A.(도착 시 이미 사망) | 1부작 | 1998.09.26 |
| 4 | Talkin' Trash(쓰레기 이야기) | 1부작 | 1998.10.03 |
| 5 | The Winter Of Our Discontent(우리 불만의 겨울) | 1부작 | 1998.10.10 |
| 6 | Cat And Mouse(고양이와 쥐) | 1부작 | 1998.10.31 |
| 7 | What Dreams May Come(천국보다 아름다운) | 1부작 | 1998.11.07 |
| 8 | Leviathan(레비아탄) | 1부작 | 1998.11.14 |
| 9 | Hive(하이브) | 1부작 | 1998.11.21 |
| 10 | Bird Of Paradise(풍조) | 1부작 | 1998.12.05 |
| 11 | DeadLoch(죽은 호수) | 1부작 | 1999.02.06 |
| 12 | Monster Wars, Part 1(괴물 전쟁, 1부) | 3부작 | 1999.02.13 |
| 13 | Monster Wars, Part 2(괴물 전쟁, 2부) | 3부작 | 1999.02.20 |
| 14 | Monster Wars, Part 3(괴물 전쟁, 3부) | 3부작 | 1999.02.27 |
| 15 | Competition(경쟁) | 1부작 | 1999.03.06 |
| 16 | Freeze(동결) | 1부작 | 1999.03.13 |
| 17 | Bug Out(버그 아웃) | 1부작 | 1999.03.20 |
| 18 | Web Site(웹사이트) | 1부작 | 1999.05.01 |
| 19 | An Early Frost(이른 서리) | 1부작 | 1999.05.08 |
| 20 | Trust No One(아무도 믿지 말라) | 1부작 | 1999.07.31 |
| 21 | Juggernaut(절대적인 힘) | 1부작 | 1999.08.14 |
2 시즌 2(1999년 ~ 2000년)
| No. | 에피소드명 | 연작 | 방송 일자(미국) |
| 1 | Future Shock(미래 충격) | 1부작 | 1999.09.18 |
| 2 | Cash Of The Titans(거인의 현금) | 1부작 | 1999.09.25 |
| 3 | S.C.A.L.E.(규모) | 1부작 | 1999.10.02 |
| 4 | Protector(보호자) | 1부작 | 1999.10.09 |
| 5 | Freak Show(괴물 쇼) | 1부작 | 1999.12.11 |
| 6 | End Of The Line(라인의 끝) | 1부작 | 1999.12.18 |
| 7 | What A Long, Strange Trip It's Been(정말 이상한 여행이 되었다.) | 1부작 | 2000.01.15 |
| 8 | Wedding Bells Blew(결혼 종이 울리다) | 1부작 | 2000.01.22 |
| 9 | Metamorphosis(변형) | 1부작 | 2000.01.29 |
| 10 | Area 51(51 구역) | 1부작 | 2000.02.05 |
| 11 | The Twister(트위스터) | 1부작 | 2000.02.12 |
| 12 | Shafted(활잡이) | 1부작 | 2000.02.19 |
| 13 | Where Is Thy Sting?(그대의 지팡이는 어디에 있는가?) | 1부작 | 2000.02.26 |
| 14 | Lizard Season(도마뱀 시즌) | 1부작 | 2000.03.11 |
| 15 | Underground Movement(지하 운동) | 1부작 | 2000.04.01 |
| 16 | Ring of Fire(불의 반지) | 1부작 | 2000.04.22 |
| 17 | Vision(비전) | 1부작 | unaired |
| 18 | The Ballard of Gens Du Marais(진 듀마레의 발라드) | 1부작 | unaired |
| 19 | Tourist Trap(관광 함정) | 1부작 | unaired |