DNA그리기 열라 귀찮았나보다
젤 전기영동과 핵산 혼성화를 조합한 방식으로 아가로오스평판으로 전기이동한 DNA 단편을 니트로셀룰로오스막에 옮긴 후 그 막에 방사선 표지를 한 DNA 또는 RNA를 혼성화시켜 목적하는 DNA를 검출하는 방법을 말한다. 1975년에 에드윈 서던(E.M Southern)이 개발한 방법이라고 하여 '서던 블로팅'이라고 한다.
대략적인 순서를 요약하면 다음과 같다.
- DNA 시료를 제한 효소[1]로 여러개의 절편으로 조각조각 절단한다.
- 잘게 절단된 DNA절편들을 홈이 파여진 아가로스 겔(Agarose gel)[2]의 홈에 넣고 전류를 흘려주면 DNA가 (-)를 띄고 있기 때문에 전기적으로 끌려 이동하게 된다. 이때 무거운 DNA절편은 느리게 이동하고 가벼운 DNA절편은 빠르게 이동하기 때문에 DNA가 사이즈 별로 나열된다.
- 겔 내부에 있는 이중 나선을 단일 나선으로 변성시킨다.
- 이 나열된 형태를 여과지로
Ctrl CV그대로 전이시킨다. - 탐지하고자 하는 DNA와 상보적인 DNA 탐침(probe)을 제조한다. 탐침은 검출을 위해 방사성 동위원소로 표지되어있다.
- 여과지와 탐침을 플라스틱 봉지에 넣어 충분한 시간동안 혼성화를 진행시킨다. 관심있는 DNA절편과 탐침이 다시 이중나선을 형성한다.
- 마지막으로 X선 필름에 여과지를 감광시켜 특정 DNA의 존재를 확인한다.