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파워퍼프걸이 소재인 공식 만화는 크게 두 시기로 나뉜다.
1 DC 코믹스
Cartoon Network와 같은 타임 워너 계열사인 DC 코믹스에서 발행했는데, 처음에는 독자적인 잡지(?)로 출발했다가 나중에는 Cartoon Network 잡지(?)로 흡수된다.
2 IDW
이후 CN이 뭔일인지 같은 타임 워너 식구인 DC를 놔두고 경쟁사인 IDW를 통해 만화를 내고 있다. 대략 이 시기를 전후로 새로운 사무라이 잭 만화 등도 IDW를 통해 나오고 있다.
2.1 섹시한(?) 표지 사건
한 호에 따라붙는 다양한 표지로도 먹고 사는 미국 만화계에서 한국계 윤미미(Mimi Yoon) 화가가 그린, 6호의 정기 구독자 전용 표지를 두고 누가 '너무 섹시해 애들 보기 안좋다'고 태클을 걸어, 많은 논란이 오고 간 끝에 해당 표지의 발행이 취소되었다.# 그러나 지금은 외려 윤미미씨에 대한 동정여론이 높아보인다. 그리고 태클을 건 사람이 전에 여자들과 부대낀 사진들을 누가 발견하는데... 그런데 그건 성인용아닌가?